南京是一个教育发达的城市，拥有多所优秀的高校。以下是南京三本院校中最好的几所学校，供您参考选择：
1. 南京航空航天大学（Nanjing University of Aeronautics and Astronautics）
南京航空航天大学是一所以航空航天为特色的理工类学校，在航空航天、动力工程、材料科学、电子信息等领域具有优势。该校建有完善的实验室设施和研究机构，拥有一支优秀的教学团队。如果您对航空航天和相关领域有浓厚的兴趣，南京航空航天大学是一个不错的选择。
2. 南京理工大学（Nanjing University of Science and Technology）
南京理工大学是一所具有综合性和特色学科优势的工科院校，其工程技术和国防科技领域享有较高声誉。该校在信息技术、机械制造、光电技术等方面具有独特的优势。南京理工大学注重理论与实践相结合的教学模式，并积极开展科研与创新工作。如果您对工程技术和国防科技感兴趣，可以考虑南京理工大学。
3. 南京邮电大学（Nanjing University of Posts and Telecommunications）
南京邮电大学是一所以信息与通信工程为主要特色的学校。该校在通信、计算机与网络技术领域具有较强的实力和声誉，其电子信息类专业毕业生就业率高。南京邮电大学以校企合作为特色，与国内外众多知名企业合作开展实践教学和科研项目。如果您对信息工程和通信技术有浓厚兴趣，并希望将来从事相关行业，南京邮电大学是一个很好的选择。
这些学校在各自领域内有自己的特色和优势。您可以根据自己的兴趣和职业规划，选择最适合您的学校。除了学校的综合实力外，您还可以考虑就业前景、师资力量、科研条件等因素，做出更加全面的判断和选择。希望以上信息对您有所帮助，祝您顺利考研！