甲醇可以清洁发动机内的积炭，促进燃料充分燃烧。
甲醇对橡胶件有腐蚀和融胀作用。
甲醇对个别金属有轻微腐蚀作用。
从我们在运城推广了5年，其中1800辆出租车行驶里程超40万公里的实际检验结果来看，未曾发现使用甲醇汽油对发动机有影响，特别是随着M85甲醇汽油国家标准的出台，产品各方面的技术参数更加优良，并且解决了冬天天冷时、或空气潮湿时的车辆启动问题。
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甲醇汽油加水分层的难题其实是针对油箱底部一般都有一部分的水，甲醇汽油加入以后，由于甲醇和水的性质相似，，所以将甲醇汽油中的甲醇萃取出来，导致分层，从而影响汽车的动力性能，甚至使得车子无法行驶。不过一般的油箱中含有的水不会太多，现在国内某些甲醇汽油企业已经可以做到一定量的水在油箱中不会产生分层，对于其动力性不影响。所以一般要找甲醇汽油添加剂好点的企业才行。